Синдзи Икари становится пилотом робота "Евангелион" для борьбы с существами под названием "Ангелы", угрожающими человечеству. Вместе с другими пилотами Аской и Рэй он участвует в серии сражений против этих существ. Организация WILLE проводит успешную операцию