Юкитэру Амано — старшеклассник, испытывающий трудности в общении со сверстниками. Для анализа социальных взаимодействий он систематически записывает наблюдения за окружающими в электронный дневник на мобильном устройстве. Стремясь компенсировать одиночество, юноша создаёт воображаемого друга по имени Деус Экс Машина, наделяя его способностями управления временем и пространством в своих фантазиях.
Воображаемый персонаж неожиданно материализуется в виде разумного существа. Деус предоставляет Юкитэру доступ к модифицированной версии дневника, получающей возможность точного предсказания будущих событий. Используя эту способность, главный герой постепенно изменяет свою социальную жизнь, корректируя действия на основе поступающих прогнозов.
В процессе использования дневника выясняется существование других владельцев аналогичных устройств среди сверстников Юкитэру. Между обладателями предсказывающих дневников начинается конкурентное противостояние, где победитель получает статус преемника Деуса. Конфликт развивается вокруг столкновения различных стратегий использования способностей предвидения.
